ミトコンペレストロイカ 漫画系列

『ジャンプスクエア』にて、2011年2月号から同年10月号まで連載後、『月刊コミック@バンチ』にて、『ミトコン ペレストロイカ』というタイトルで2013年6月号から2017年4月号まで連載された。「@バンチ版」は続編ではなく、リライト+加筆修正で構成されている。初期の帯には庵野秀明・安野モヨコ夫妻による「元気をもらいました」というコメントが付いている。

祖父であるミトコンドリア大王に溺愛されていたせいでずっと城に閉じ込められていたマゴコンドリア姫はある日、城を飛び出すことに成功する。一方山賊たちが、とある馬車の荷台の中に非常に高価なものがあると告げられ、それを襲撃する。