AMX-004-3 キュベレイMk-Ⅱ（プルツー専用機）

ハマーン・カーンが搭乗した試作1号機のマイナーチェンジ・バージョン。基本的な機体構成は同じである。当時アクシズ内にて養成されていたクローン・ニュータイプの能力を査定する為に製造されたとも言われている。ビーム・サーベルの基部が3方向に展開可能など、若干の改修がされている他、サイコミュ・コントローラーによる外部制御が可能な仕様の機体も存在する。

プルツー用の3号機（サイコミュ・コントローラー搭載機、赤色）はハマーン・カーン暗殺任務の際に近衛部隊のゲーマルク、ガズアル、ガズエルと交戦した他、エゥーゴのΖΖガンダムとも交戦している。

優れたサイコミュ兵装を有するキュベレイであったが、そのオールレンジ攻撃もΖΖガンダムには通用せず、ネェル・アーガマによるハイパー・メガ粒子砲の余波を受け、機体は破壊される（搭乗者のプルツーは無事に脱出している）。 この、キュベレイＭkーⅡプルツー機は外から操作・操縦ができるようになっている。